L’Unité de Coordination du Partenariat de Ouagadougou a été créée en 2012 pour coordonner les actions du Partenariat et les relations entre les bailleurs et les pays afin d’atteindre les objectifs fixés. Basée à Dakar, les missions de l’UPCO sont la facilitation du processus de partenariat, l’assistance aux pays pour achever le processus de planification et pour la mise en oeuvre des plans d’action, le suivi des progrès par rapport aux objectifs et le partage d’informations.